- a -

• add_gal() : Cluster
• add_member() : FoF
• angdidis() : Cosmo
• angdidis2() : Cosmo
• angsep() : Astro
• assign_bin() : Galaxy
• assign_bins() : Galaxy
• assign_cluster_props() : Cat_Merge , Main
• assign_dist() : Cluster , Galaxy , Zbin
• assign_fixed_rfriend() : Zbin
• assign_linking_param() : Main
• assign_props() : Cluster
• assign_rfriend() : Zbin
• assign_sn() : Cluster

- b -

• background_counts() : Main
• BadArgumentException() : BadArgumentException
• Band_Matrix() : Band_Matrix
• bin_check() : FoF
• build_kdtree() : Kdtree

- c -

• check_node() : Kdtree::Kdtree_node
• check_pos() : Cat_Split
• check_results() : Main
• clear() : Cluster
• close_files() : Cat_Split
• Cluster() : Cluster
• comdis() : Cosmo
• comvol() : Cosmo

- d -

• d_h_m_s() : Comp
• dcomdisdz() : Cosmo
• dcomvoldz() : Cosmo
• deg2rad() : Astro
• dim() : Band_Matrix
• distance() : Point
• dlookbackdz() : Cosmo
• DomainException() : DomainException
• doptdepthdz() : Cosmo
• dpropmotdisdz() : Cosmo

- e -

• end_time() : Comp
• existing_clt() : Merge_Fileio

- f -

• find() : UnionFind
• find_bin() : Astro , Cat_Split
• find_friends() : FoF , Main
• find_friends_of_friends() : FoF
• FoF() : FoF
• friends_of_friends() : FoF
• friendship() : FoF

- g -

• Galaxy() : Galaxy
• GalaxyCompCoord() : GalaxyCompCoord

- i -

• intcomvol() : Cosmo
• is_singleton() : UnionFind

- j -

• join() : UnionFind
• join_uf() : Merge

- l -

• l_solve() : Band_Matrix
• lookback() : Cosmo
• lu_decompose() : Band_Matrix
• lu_solve() : Band_Matrix
• lumdis() : Cosmo

- m -

• make_kdtree() : Main
• max() : Astro
• mean() : Astro
• median() : Astro
• merge_clusters() : Cat_Merge , Main
• min() : Astro

- n -

• new_cluster() : FoF
• num_bins() : Astro
• num_lower() : Band_Matrix
• num_upper() : Band_Matrix

- o -

• open_files() : Cat_Split
• operator()() : Band_Matrix , GalaxyCompCoord , Spline
• operator+() : Point
• operator-() : Point
• operator=() : Point
• optdepth() : Cosmo
• output_cluster_name() : Fileio
• output_file_names() : Merge_Fileio
• output_member_name() : Fileio
• output_results() : Main

- p -

• Point() : Point
• print_node_info() : Kdtree::Kdtree_node
• print_parameters() : Option
• print_time() : Comp
• propmotdis() : Cosmo
• psqdistance() : Point

- r -

• r_solve() : Band_Matrix
• rad2deg() : Astro
• range_search() : Kdtree
• range_search_loop() : Kdtree
• read_ascii() : Cat_Split , Fileio , Merge_Fileio
• read_bg_data() : Merge_Fileio
• read_data() : Main
• read_file_list() : Merge_Fileio
• read_files() : Cat_Merge
• read_fits() : Fileio , Merge_Fileio
• read_merge_opts() : Option
• read_nz_data() : Fileio
• read_options() : Cat_Merge , Cat_Split , Main
• read_opts() : Option
• read_split_opts() : Option
• rearrange_clusters() : Merge
• remove() : FoF
• rename() : Cluster
• resize() : Band_Matrix
• RuntimeException() : RuntimeException

- s -

• saved_diag() : Band_Matrix
• set_cluster_status() : Galaxy
• set_Kdtree() : Kdtree
• set_points() : Spline
• set_up() : Cat_Split , Cosmo , Fileio
• set_up_zbins() : Main
• setup() : FoF
• Spline() : Spline
• split() : Fileio
• sqdistance() : Point
• start_time() : Comp
• stderr_mean() : Astro
• stderr_median() : Astro
• stdev() : Astro

- u -

• UnionFind() : UnionFind
• unique() : Cluster
• update_size() : Cluster

- v -

• variance() : Astro
• version() : Option

- w -

• WalkTree() : Kdtree
• what() : BadArgumentException , DomainException , RuntimeException
• within() : Astro
• write_ascii() : Fileio
• write_files() : Cat_Merge
• write_fits() : Fileio
• write_Kdtree() : Kdtree

- z -

• Zbin() : Zbin

- ~ -

• ~BadArgumentException() : BadArgumentException
• ~Band_Matrix() : Band_Matrix
• ~DomainException() : DomainException
• ~RuntimeException() : RuntimeException